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計算化学関連
| 種別 | 名称 |
Ver. | 主なコマンド |
インストール | Doc | 注意事項 |
| 第一原理計算 | Quantum Espresso | 5.0.2 |
bands.x, cp.x, kpoints.x, pmw.x, pp.x, pw.x etc. | 2012/12/5 | |
設定・マニュアル |
| 半経験的軌道法 | MOPAC | 2012 |
mopac | 2012/12/5 | ○ |
特になし |
| 分子動力学 | Gromacs | 4.5.3 |
mdrun, pdb2gmx, grompp, make_ndx | 2011/12/14 | ○ | 特になし |
| 分子動力学 | NAMD | 2.8 |
namd2, charmd, charmrun | 2011/12/16 | ○ | 特になし |
| フォーマット変換ツール | OpenBabel | 2.2.0 |
babel | 2011/12/14 | ○ | 特になし |
可視化・描画関連
| 種別 | 名称 |
Ver. | 主なコマンド |
インストール | Doc |
| 分子ビューア | MOLMOL | 2.6.0 |
molmol | 2011/12/22 | ○ |
| 分子ビューア | Jmol | 12.2.9 |
jmol | 2011/12/16 | ○ |
| 2次元プロットツール | gnuplot | 4.2.3 |
gnuplot | 2011/12/17 | ○ |
| 分子ビューア | VMD | 1.9 |
vmd | 2011/12/16 | ○ |
| ２次元プロットツール | xmgrace | 5.1.21 |
xmgrace | 2011/12/14 | ○ |
数学・物理関連
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