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田村 武幸(たむら たけゆき)
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
数理生物情報研究領域 准教授
情報学研究科知能情報学専攻
にて修士および博士課程学生の指導資格がありますので、興味のある方は以下のメールアドレスに御連絡ください。
tamura at kuicr dot kyoto-u dot ac dot jp
日本語解説記事 「
有用物質生産のための代謝ネットワーク設計
」(隣接分野の学生さんでも読めると思います。)
科研費・基盤B代表「
有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム (令和2年度〜令和6年度)
」
論文リスト
MetNetComp
(有用物質生産のための遺伝子削除戦略のデータベース(simulation-based))
研究テーマ
近年は「数理代謝工学」の研究をしています。
遺伝子ネットワークや代謝ネットワークの設計や制御、木の編集距離や最大共通部分グラフに興味があります。
研究助成金
研究代表者分
有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム (科研費・基盤研究B代表 令和2年度〜令和6年度)
生産困難化合物を生成するFBAモデルの代謝ネットワークの設計 (京都大学教育研究振興財団 研究活動推進助成:代表 令和元年度)
数理モデルによる生体ネットワーク制御手法の開発
(科研費・基盤研究C:代表 平成28年度〜令和元年度)
ブーリアンモデルによる生体ネットワークの統合的な数理モデル化と解析
(科研費・若手研究B:代表 平成25年度〜平成27年度)
ブーリアンモデルによる遺伝子制御ネットワークの解析
(科研費・若手研究B:代表 平成23年度〜平成24年度)
研究分担者分
細胞の生存 - 自然界における大腸菌の場合
(科研費・基盤研究A:分担 平成28年度〜平成30年度)
長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略
(科研費・基盤研究A:分担 平成25年度〜平成27年度)
所属学会
IEEE
日本バイオインフォマティクス学会
電子情報通信学会
情報処理学会
略歴
1990年 4月〜1996年 3月
東大寺学園中・高
1996年 4月〜2001年 3月
京都大学
工学部情報学科 (計算機科学コース)
2001年 4月〜2003年 3月
京都大学大学院情報学研究科
通信情報システム専攻 修士課程
2003年 4月〜2006年 3月
京都大学大学院情報学研究科通信情報システム専攻
博士後期課程
2006年 3月 京都大学博士(情報学)の学位を取得
2006年 4月〜2007年 11月
京都大学化学研究所
バイオインフォマティクスセンター 博士研究員
2007年 12月〜 2017年 9月
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
助教
2017年 10月〜
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
准教授
(情報学研究科
知能情報学専攻
協力講座)