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Intel コンパイラ

機能概要

プログラミング開発環境としては　2021年版以降は Intel oneAPI ベース&HPCツールキット、それ以前のバージョンについては Intel Parallel Studio XE Cluster Edition for Linux が利用できます。これらは、C/C++コンパイラ、Fortranコンパイラ、パフォーマンス・ライブラリーに加え、パフォーマンス/エラー解析ツールやMPI開発ツールも備えた開発環境です。

プログラミング手法やコードの最適化・並列化に関する詳細な説明については、マニュアルや関連サイトのリンク先の情報をご参照ください。

利用方法

すべてのキューにてIntelコンパイラは利用可能です。また、ログインノード(apfe1) にて直接コンパイルしていただくことも可能です。
コンパイルおよび実行したい場合、以下を参考にmoduleコマンドで必要な環境設定を行ってください。

利用できるバージョンと環境設定方法(Intel oneAPIの場合)

Intel oneAPIでは、利用したいモジュール毎に環境設定を行います。

利用できるモジュール名は以下の通りです。

advisor        dal            dpct                 intel_ipp_intel64  tbb32
ccl            debugger       dpl                  itac               vpl
clck           dev-utilities  init_opencl          mkl                vtune
compiler       dnnl           inspector            mkl32
compiler32     dnnl-cpu-gomp  intel_ippcp_ia32     mpi
compiler-rt    dnnl-cpu-iomp  intel_ippcp_intel64  oclfpga
compiler-rt32  dnnl-cpu-tbb   intel_ipp_ia32       tbb

様々なモジュールファイルがありますが、compiler と compiler32 のように、同じモジュール名で最後に32があるものは32bit版、何も数字がないものは64bit版です。

モジュールごとにどのバージョンが利用可能かを確認するには、avail というキーワードを指定します。例えば、どのバージョンのcompilerが利用できるかを確認するには、次のように実行します。

module avail compiler
--------------------------------- /usr/appli/intel/modulefiles ---------------------------------
compiler-rt/2021.1.1  compiler-rt/latest      compiler-rt32/2023.2.1  compiler/2022.1.0    compiler32/2022.0.2  
compiler-rt/2021.2.0  compiler-rt32/2021.1.1  compiler-rt32/latest    compiler/2023.2.1    compiler32/2022.1.0  
compiler-rt/2022.0.2  compiler-rt32/2021.2.0  compiler/2021.1.1       compiler/latest      compiler32/2023.2.1  
compiler-rt/2022.1.0  compiler-rt32/2022.0.2  compiler/2021.2.0       compiler32/2021.1.1  compiler32/latest    
compiler-rt/2023.2.1  compiler-rt32/2022.1.0  compiler/2022.0.2       compiler32/2021.2.0

通常、ソースコードをコンパイルする場合は以下の通りです。

module load compiler
icc test.c
./a.out

intelMPIを使ってコンパイルしたい場合は以下のようにmpiモジュールのロードも必要です。

module load compiler
module load mpi
mpiicc test.c -lmpi
mpirun -np 4 ./a.out

Intel MPI利用時の注意点

Intel MPIでコンパイルしたジョブをPBSに投入して実行する場合、PBSのバッチスクリプト内で以下の設定を追加してください。
特にノードをまたいでジョブを実行する場合、以下の設定がないとエラーが発生します。

(C-Shellの場合)
setenv I_MPI_HYDRA_BOOTSTRAP rsh
setenv I_MPI_HYDRA_BOOTSTRAP_EXEC /usr/appli/pbs/default/bin/pbs_tmrsh

Intel oneAPI 2023.2.1以降利用時の注意点

バージョン2023.2.1以降を利用する場合、事前にgcc 5.5.0もしくはそれ以降のバージョンの環境設定をお願いします。

module load gcc/5.5.0
module load compiler/2023.2.1
ifort -V
Intel(R) Fortran Intel(R) 64 Compiler Classic for applications running on Intel(R) 64, Version 2021.10.0 Build 20230609_000000
Copyright (C) 1985-2023 Intel Corporation.  All rights reserved.

もし、gcc/5.5.0 の環境設定がない場合、glibcxx 3.4.21 がない、といったエラーが発生します。

module load compiler/2023.2.1
ifort -V
ifort: /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found (required by ifort)

お手数ですがよろしくお願いします。

利用できるバージョンと環境設定方法(Intel Parallel Studioの場合)

Intel Parallel Studioでは、利用したいバージョンを指定して環境設定を行います。

バージョン	設定方法
2020 update4	module load intel/2020.4
2020 update1	module load intel/2020.1
2019 update5	module load intel/2019
2018 update4	module load intel/2018
2017 update8	module load intel/2017
2016 update4	module load intel/2016

サンプル

サンプルファイルは、/usr/appli/intel/YYYY.V/samples_YYYY/ にあります。( YYYYは西暦(4桁)、V はマイナーバージョンです)

マニュアル

プログラミング並列化・最適化講習会2020

なお、Intel oneAPIのマニュアルについては、以下の関連サイト(Documet Library等）をご参照ください。