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OmegaFold はHelixon US Incが開発したタンパク質立体構造予測プログラムです。OmegaFoldはAlphafold2とは違いmultiple sequence alignments (MSA)を用いないので、より速く計算できます。 利用方法実行コマンドは omegafoldです。環境変数OMP_NUM_THREADS で使用コア数を指定します。 (例) 10コアを使用して実行$ module load omegafold/1.1.0 $ omegafold -h # オンラインヘルプを表示 $ env OMP_NUM_THREADS=10 omegafold input_file output_dir GPU搭載ノード(APG キュー)で実行すると計算が大幅に速くなります。 ライセンスOmegaFoldのライセンスは Apache License 2.0です。利用に特に制限はありません。 関連ページ |
